无尽拉格朗日作为一款深度策略太空游戏，舰船选择直接影响玩家的发展效率和战斗表现。根据舰船功能可分为战斗型与资源采集型两大类，战斗型又细分为护卫舰、驱逐舰、巡洋舰、战列巡洋舰和航空母舰等。资源采集型主要包括工程船和贸易船，其中大型工程船因采集效率最高成为首选。战斗舰船中，驱逐舰的实用性尤为突出，例如斗牛级脉冲炮驱逐舰凭借高攻击上限成为新手开荒利器，枪骑兵级和苔原级则因均衡性能与支援能力被广泛采用。巡洋舰中卡里斯托级综合性能优异，而战列巡洋舰如ST59级和乌拉诺斯之矛级则以高防御成为后期核心战力。
舰船强度并非绝对，需结合战场环境动态调整。例如护卫舰中红宝石级和刺水母级凭借高闪避特性适合高速突击，而驱逐舰谷神星搭载小飞机后可显著提升支援能力。航母CV3000级因其舰载机配置位列顶级战舰，但需搭配防空舰船保护。同一舰船的不同子型号可能完全改变定位，如雷利亚特级隐身护卫舰通过改装可转型为高爆发或高生存单位。这种剪刀石头布式的克制关系要求玩家尽可能收集多样舰船以应对不同阵容。
大型工程船在单一资源点效率最优，而运输任务推荐使用侦察护卫舰等具备高巡航速度与大仓储空间的型号。贸易船虽非战斗单位，但能通过商品交换快速获取金币与资源，对势力发展至关重要。采矿艇专注于氘、水晶等战略资源采集，科研船则通过长期研究产出稀有物资。这些功能性舰船虽不直接参与战斗，却是支撑舰队扩张的基础。
舰队编组需兼顾移动速度与火力配比。主力舰队应以6艘以上能抗能打的前排舰为核心，搭配高攻巡洋舰或战列舰，移动速度建议保持在400-500区间。高速输出舰队则需优先选择移速650以上的舰船，如永恒风暴级巡洋舰或枪骑兵级驱逐舰，利用包夹战术绕过敌方前排直击要害。维修船在前期价值显著，但后期因治疗量不足逐渐被纯输出舰替代。玩家可通过增援指令临时调整舰队配置，例如面对航母编队时增援防空护航艇。
技术强化是提升舰船战力的关键路径。每艘舰船的武器、护甲、动力等系统均可通过技术值升级，例如AC721驱逐舰应优先强化命中率与伤害属性。技术值主要通过战斗经验、任务奖励或氪金获取，建议集中资源培养核心舰船至金标等级。舰载机如林鸮A100型与孢子A404型需单独强化，其对空作战效能可改变战局走向。
舰船选择需平衡即时战力与长期发展需求。初期以驱逐舰和护卫舰为核心快速积累资源，中期转向巡洋舰与航母构建混合编队，后期则依赖战列舰与高级航母争夺星系控制权。玩家应根据实际获取的蓝图调整策略，无需盲目追求稀有度，合理搭配的普通舰船同样能形成有效战斗力。
