舰队编组是无尽的拉格朗日中提升战斗效率的核心操作。首先需要进入基地界面，选择舰队编组功能，系统会显示当前可用的所有舰船。一支舰队最多可容纳300指挥值的舰船，基地升级至九级并解锁相关建筑后可提升至400指挥值。舰船在舰队中的位置分为前排、中排和后排，敌方会优先攻击前排舰船，其次中排，最后后排。需舰船位置由蓝图中的舰船定位决定，无法手动调整。
创建舰队时需要为舰队命名，可选择自定义或系统自动生成。合理的命名有助于快速识别舰队功能，例如将主力舰队与资源采集舰队区分开。舰队创建完成后，可在编组界面查看详细属性，包括火力、舰船构成、移动速度和仓储容量等关键数据。这些信息是后续战术调整的基础。
前排应配置高防御或高闪避的舰船承担伤害，如守护艇或强化护甲的驱逐舰；中排选择兼具攻防能力的巡洋舰或特殊功能舰；后排部署高输出舰船如战列巡洋舰或搭载战机的航母。载机舰船需注意其搭载的护航艇或战机类型，针对敌方阵容选择防空或对舰型号。
针对不同作战目标调整舰队构成，攻城作战需配备攻城火力突出的舰船，防御战则需增加维修舰和防空单位。舰队移动速度由编队中最慢舰船决定，高速机动舰队应统一选择速度相近的舰船。可通过增援功能临时补充高人口舰船，但需注意增援会改变原有航行速度。
通过战报分析舰队表现，及时更换低效舰船或调整技术值分配。维修舰在对抗低级野怪时效果显著，但高强度PVP中建议替换为输出单位。定期检查蓝图研究进度，优先强化主力舰船的武器系统和生存能力。多舰队协作时需保持速度协同，避免因机动性差异导致战术脱节。
